抑制器可避免在未通液體時空轉，以減少柱芯陶瓷，片磨損在長時間走基線時要定時切換抑制柱，否則背景值明顯增高。離子色譜儀分離柱則會設定的流速不能超過柱子所允許的zui大流速。在測定過程中色譜柱壓力也應保證在所允許的壓力范圍之內。短時間不用，可以直接將柱子兩端蓋上塞子，放在盒中保存。若長時間不用（1個月以上），陰離子柱應保存到10 mmol/L Na2CO3中，陽離子柱則應在冰箱內冷藏保存（4攝氏度）。重新安裝色譜柱時應出口向上，便于將氣泡趕出。